Οι ακτινοφυσικοί από το Τμήμα Ιατρικής Φυσικής εκπονούν το πλάνο θεραπείας, καθορίζουν τον τρόπο με τον οποίο θα χορηγηθεί η θεραπεία, επιλέγοντας τη γεωμετρία των πεδίων ακτινοβολίας, φροντίζοντας η περιοχή που έχει σχεδιάσει ο ιατρός να λάβει τη μέγιστη δόση ενώ οι γύρω υγιείς ιστοί την ελάχιστη εφικτή. Τα πλάνα θεραπείας επιβεβαιώνονται με μετρήσεις στο μηχάνημα ή ανεξάρτητους υπολογισμούς πριν από την έναρξη της θεραπείας.
